网页资讯视频图片知道文库贴吧地图采购
进入贴吧全吧搜索

 
 
 
日一二三四五六
       
       
       
       
       
       

签到排名:今日本吧第个签到,

本吧因你更精彩,明天继续来努力!

本吧签到人数:0

一键签到
成为超级会员,使用一键签到
一键签到
本月漏签0次!
0
成为超级会员,赠送8张补签卡
如何使用?
点击日历上漏签日期,即可进行补签。
连续签到:天  累计签到:天
0
超级会员单次开通12个月以上,赠送连续签到卡3张
使用连续签到卡
10月26日漏签0天
r语言吧 关注:24,667贴子:56,698
  • 看贴

  • 图片

  • 吧主推荐

  • 游戏

  • 6回复贴,共1页
<<返回r语言吧
>0< 加载中...

请教关于WGCNA的TOMsimilarity

  • 只看楼主
  • 收藏

  • 回复
  • simon930123
  • 小学
    2
该楼层疑似违规已被系统折叠 隐藏此楼查看此楼
使用WGCNA,用到TOMsimilarity函数时出现如下报错,请教大神如何解决:


  • simon930123
  • 小学
    2
该楼层疑似违规已被系统折叠 隐藏此楼查看此楼
报错:Error in TOMsimilarity(adjacencyP, TOMType = NETWORKTYPE, verbose = 1) :
long vectors (argument 1) are not supported in .Fortran


2025-10-26 11:03:43
广告
不感兴趣
开通SVIP免广告
  • simon930123
  • 小学
    2
该楼层疑似违规已被系统折叠 隐藏此楼查看此楼
命令:
#Calculate adjacencies
adjacencyP = adjacency(datExprPetunia, power = softPower, type=NETWORKTYPE);
#Topological Overlap Matrix (TOM)
TOM = TOMsimilarity(adjacencyP, TOMType=NETWORKTYPE, verbose=1);


  • simon930123
  • 小学
    2
该楼层疑似违规已被系统折叠 隐藏此楼查看此楼
求教了


  • 505514406
  • 学前
    1
该楼层疑似违规已被系统折叠 隐藏此楼查看此楼
Error in TOMsimilarity(adjacencyP, TOMType = NETWORKTYPE, verbose = 1) :
long vectors (argument 1) are not supported in .Fortran
在Fortran中不支持long向量,你的argument1是不是long向量


  • 505514406
  • 学前
    1
该楼层疑似违规已被系统折叠 隐藏此楼查看此楼
你上那个R frequent question 上面搜过没|?
还有关于WGCNA包的应用在Bioconductor有专门的文档,Horvath S有详细的文旦,从第一步到第六步,详细的介绍,不会的看看帮助文档,很详细的。


  • gem_neosun
  • 学前
    1
该楼层疑似违规已被系统折叠 隐藏此楼查看此楼
bwnet = blockwiseModules(datExpr, maxBlockSize = 2000,
power = 6, TOMType = "unsigned", minModuleSize = 30,
reassignThreshold = 0, mergeCutHeight = 0.25,
numericLabels = TRUE,
saveTOMs = TRUE,
saveTOMFileBase = "femaleMouseTOM-blockwise",
verbose = 3)
Error in (function (x, y = NULL, use = "everything", method = c("pearson", :
unused arguments (weights.x = NULL, weights.y = NULL, cosine = FALSE)
这个怎么解决?


登录百度账号

扫二维码下载贴吧客户端

下载贴吧APP
看高清直播、视频!
  • 贴吧页面意见反馈
  • 违规贴吧举报反馈通道
  • 贴吧违规信息处理公示
  • 6回复贴,共1页
<<返回r语言吧
分享到:
©2025 Baidu贴吧协议|隐私政策|吧主制度|意见反馈|网络谣言警示