口服核苷(酸)类似物在国内上市已近20年，目前已有拉米夫定、阿德福韦酯、替比夫定、恩替卡韦和替诺福韦等6种药物在国内上市，临床应用患者数百万计。有人说，口服抗病毒药物“初期看疗效，后期看停药”，什么时候能停药是广大用药患者最为关心的问题，也是微博中患者咨询较多的问题之一。
由于乙肝病毒可以在肝细胞内形成共价闭合环状DNA(cccDNA)，这正是乙肝患者停药后易复发的分子基础。目前已有口服抗病毒药物对于cccDNA均无直接作用，仅能通过长期病毒抑制逐渐消耗cccDNA库，最终达到减少复发的目的，这也是临床推荐口服抗病毒药物治疗疗程的理论基础。
目前，2015年版《慢性乙型肝炎防治指南》对于有意愿停药的患者是这样推荐的：
一、e抗原阳性的慢性乙型肝炎：口服核苷(酸)类似物治疗在达到乙肝病毒低于检测下限、谷氨酸氨基转移酶恢复正常且发生e抗原血清学转换后再继续巩固治疗至少3年(每隔6个月复查1次)仍维持以上结果不变者，且总疗程达到至少4年，可考虑停药。停药并不能保证能维持以上结果，但是延长疗程可减少复发。
二、e抗原阴性的慢性乙型肝炎：e抗原阴性的慢性乙型肝炎抗病毒治疗的具体疗程尚不明确，且停药后肝炎复发率高，因此治疗疗程宜长。至于说多长，目前并无推荐意见，在未发生病毒耐药且无明显副作用的情况下可考虑长期用药，如出现耐药或明显副作用，应根据具体药物进行调整治疗。
三、无论对于e抗原阳性还是e抗原阴性慢性乙型肝炎，口服核苷(酸)类似物治疗在达到乙肝表面抗原消失且乙肝病毒定量低于检测下限，再继续巩固治疗1年半(至少经过3次复查，每次检测6个月)仍维持不变者，可考虑停药。
四、无论对于e抗原阳性还是e抗原阴性慢性乙型肝炎，口服核苷(酸)类似物治疗在达到乙肝表面抗原消失且乙肝表面抗体出现，乙肝病毒定量低于检测下限，可考虑停药。
五、对于慢性乙型肝炎病情已进展至肝硬化的患者，需要长期抗病毒治疗，不建议任何时候停药，否则可能会导致病情恶化。
六、对于妊娠期间因乙肝病毒定量超过2×106IU/ml且在24-28周选择口服抗病毒药物预防母婴感染的妊娠女性，建议于分娩后1-3个月停药，总疗程不宜超过6个月。
七、对于因应用免疫抑制剂和化疗而预防性应用抗病毒治疗的患者，在免疫抑制剂和化疗疗程结束后应继续应用口服核苷(酸)类似物治疗6个月以上再考虑停药，但停药后仍有复发甚至病情恶化风险，应注意随访和监测。
八、对于因慢性乙肝导致的的原发性肝癌患者，因手术、射频消融、放射治疗和肝动脉栓塞等治疗均可能导致乙肝病毒复制活跃，且肝癌术后乙肝病毒定量是预测术后复发的独立危险因素之一，建议长期应用口服核苷(酸)类似物治疗，并优先选择恩替卡韦或替诺福韦。
九、HBV相关的肝移植患者术后需要终身服用口服核苷(酸)类似物以预防乙型肝炎复发。