请教ERP高手回答，谢谢！

碰到如下难题： 
手袋厂ERP。比如说我们订单数量是500PCS，但因我们要留底样3PCS（必须要加的），所以我们订单数量是500PCS，而制令单是503PCS，即使打了入库单及出货单、核销单（都是打的500PCS），但系统还是没办法结账完成，因为还余3PCS。 
现在公司的解决方法是：强制令完工，但因查询的时候所有没有完成的制令单都在里面，需要一项一项的核对再强制令完工。（也就是说我出货了某一订单号，需把所有的订单调出来一项一项的来核对，找到出货的那一张订单再强制令完工）。没有办法去查询输入某一订单号直接强制令完工。 
所以我就感到很不解，请高手指点！谢谢！