崩溃！6个月后资料被市局退回区里

我是4月提交，5月受通，7月补交过一次材料，但迟迟没有公示，所以托人去市局打听了一下，结果就是这周一已经被退回浦东区，说是劳动关系不对！我自毕业就一直在上海工作，6年前换过一次工作，唯一的瑕疵是我的户口挂靠在南京一家公司（因为毕业后不想被迁回老家，现在想来太幼稚）。昨天去区窗口问，说系统还显示正常，但一般要两周区里才能收到被退的材料！具体是不是我猜的那个瑕疵还不确定（因为我补过那家公司的不在职证明），砍头都不能痛快点。。。6个多月就换来这个结果，唉！有遇到类似问题的吗？