楼主的思考非常深刻啊。
如果觉得剧情有点乱的话，可以参考这个时间表：http://tieba.baidu.com/f?kz=701411274
整个剧情一目了然。
关于第五点问题，可以看看这个帖子：http://tieba.baidu.com/p/987376904
虽然不是官方解释，不过个人觉得很具有启发性。

今天看了end33，把一个多月以来断断续续打游戏的感想整理一下。话说我进度真是慢啊＠_＠
首先，三点间的时空间转移。虽然是三点之间，但变量有十二个，严格来说是六个……我果然不是理性动物，悟在整理转移的情况时，完全头晕orz看来没时间表我是真不能捋顺情况啊orz感觉脑子里都搅成毛线团了w(ﾟДﾟ)w真悟在end33里面说假悟的人格没有感受过气压变化的过程，而心则感受到了，是因为三点转移，这个过程到现在也没有搞清楚……虽然这个问题不是什么重要的问题啦，但是脑子空转了好长时间orz
第二，关于犬伏景子。鉴于剧情中她明显精神不稳定的描写，我认为不能用常人的逻辑去思考她的因为。正因如此，她自然地接受了穗鸟这个名字就可以理解了。一方面，她从来没被人这样叫过，觉得这样很有趣；另一方面，她也可能讨厌自己的本名，毕竟杀人事件过去这么长时间，她不可能什么人都没接触过，别人提到这个名字时那种恐惧的反应，可能让她开始讨厌自己这个本名也说不定。另外，游戏不管op还是广播剧之类的东西里，都没有出现过犬伏景子这个名字，也就是说，这个名字只出现在了游戏的剧情里，还有tips里。不知这是否有什么原因？
三，关于第二组转移，读过一些前辈的分析之后，个人认为引起人格残留的原因可能是犬伏能够看到self，或感觉到self的存在。她调戏悟的话，说不定其实对象是self，她好奇self会有什么反应。当self发生人格残留的时候，能够观测到self存在的她的人格也同时残留下来。但如果转移同时发生的话，有喜糖是如何有把握悟一定会跟心交换肉体呢？难道也是TB光盘的指点？
第三，闹钟到底是谁调的，目的又是什么？拖时间？想想有可能是悟自己调的，但还是想不明白为什么……
嗯暂时先写这些，想到了再写。总之想问的问题都能写成一本十万个为什么啦。

订正，是end31……

再补充一点,犬伏的人格,我认为一直就是犬伏.
复习心那本书的时候也可以知道 犬伏人格包含多种
但应该都被犬伏这个主人格控制着
这么说吧,犬伏根本没有雪山上转移这个点
我认为她的转移是这样的 犬伏(含多种其他人格)+婴儿B
是两点转移 而不是三点转移
犬伏包含多种人格举例; 打篮球\吃饭\保护悠尼一本正经的人格,吻吃mao倒在悟床上的人格,失语人格,拼命求救求保护的人格,给下本豪迈撞击的人格,摔死老鼠的人格,发病狂暴的人格等
shadow让玩家感到雪地里有个人格
shadow被灌输了穗鸟的一些残留意识,将自己称为穗鸟,这点和self一样,称自己为悟
shadow也倍受惩罚,何时才能离开牢笼.