传统中医的发展是随着社会的稳定与和谐而发展的，要创造和谐首先要包容，包容就要和谐历史，重新审视我们错误的认识。
祝由科为中医技术提供保障，一直流传到建国以前。相传上古涿鹿之战，黄帝的军队九战九败，士兵水土不服，伤痛缠身，瘟疫流行，缺少医药，黄帝焦虑万分，巡营时，看到一个人口中念念有词，亦歌亦舞，熬制草水给战士喝，随军的中军告诉黄帝：“他是祝融的哥哥祝由，正在给伤者治病”；黄帝非常高兴，于是传令全军由祝由医治，最后全军振作起来，消灭了瘟疫打败了蚩尤部族，奠定了中华大地的根基；从此祝由医学技术也就流传了下来，广泛传播。
《周礼·大聚》：“乡立巫医，具百药，以备疾灾。”反映了巫医在朝野普遍存在。巫观念的严重存在与积淀，是巫医得以生存的重要条件。随着生活水平的提高，因而祭祀鬼神、禳（去）除疾病的巫风盛行，大量反映在甲骨卜辞中。巫就是医，担负当时治疗疾病的责任。
《逸周礼·大聚》中规定：“乡立巫医，具百药以备疾灾。”每个乡的巫医要储备药物，防备急病。确定了巫与医相结合的基础医疗体系，这里的巫的作用是对气候与疾病的预测和了解，以及采取相应的措施。最早记录医师制度是《周礼》，“医师掌医之政令，聚毒药以共医事”“食医掌和王之六食、六饮、六膳、百羞、百酱、八珍之齐”“疾医掌万民之疾病”“疡医掌肿疡、溃疡、金疡、折疡之祝药，剐杀之齐”。“兽医掌疗兽病疗兽疡”。药医与祝医要同时存在，相互补充制约，
《资治通鉴》中就有汉中央政府强令“乡约祝医”（每个乡都设立祝由医疗站，解决农民看病）的记载。
元代还把医事更加分化，分为十三科，即；祝由科、大方脉科、小方脉科、杂脉科、风科、产科、眼科、口齿科、咽喉科、正骨科、金疮肿科、针灸科、禁科，祝由科依例配备医博士，故民间有“中医十三科，不识祝由科，别称十三科之说”。它的分科不以症状分类，每一科都是全科大夫，对于病是以人的整体功能为中心，就避免了诊断的偏颇。
清代每年还为龙虎山留祝由科博士职位。