说来惭愧，楼主对太复杂的谜语不是很了解，所以基本上是边看攻略解决掉所有解密的。
然后又在本吧看了一些帖子，有了一些猜测。
首先是ZU村的制度问题，在深蓝世界的一个房间内可以看到方脑袋人的社会结构，但是ZU村子里却缺少一个职位，国王。
那么国王去哪了呢？
在初始的村庄里，有个房间里挂着方脑袋所有阶级的照片，可以看到国王和其他所有人都不一样，不仅仅是他有两条粗眉毛，更是有眉毛中间的那个方框
那个方框是从外星人赐福以后出现的，而且更在拥有FEZ帽子的人的地位置上，所以理应当判断出，国王拥有比FEZ更强的能力才对。
再看原始人的壁画，所有被杀死的方脑袋人都是侧面像，说明，原始人和勾妹子村子里的人一样是二维的。
所以我提出假设，外星人从原始人遗迹的那个充满了黑洞的房间冒出来，救下了被原始人追杀的方脑袋人，并且赐予了他们语言，技术，于是他们创造了灿烂的文明。
当然，方脑袋人并不是铁板一块，从外星人赐福，还有方脑袋人的社会结构两个图上相比较，可以看出两边都有一个带着FEZ帽子，脑袋旁边有个点的方脑袋人，再加上雨城，有个骷髅头上的幽灵说DOTS不能信，可以猜测，当初方脑袋的高层之间肯定发生过什么。
还有和DOTS有关的就是有很多门的房间，那里入口背面的文字翻译过来就是 DOTS TO DOTS，如果其中一个是人名的话，那么就应该翻译成DOTS去的地点，没错，白色骷髅神器应该是被DOT偷了，并且藏在了那里。
因为DOTS自己也有FEZ帽子，所以他也可以穿梭时间与空间，于是他穿过初始村子下面的门所通往的各个时间和空间，把藏宝图纸分别藏在了那里。
当然，这也只是我的一点猜测。