2013年5月5日国务院公布：
编号：7-0282-1-282 古遗址类 造律台遗址（永城）新石器时代
编号：7-0304-1-304 古遗址类 柘城孟庄遗址 商代
编号：7-0326-1-326 古遗址类 芒砀山汉代礼制建筑基址（永城） 汉代
编号：7-0327-1-327 古遗址类 柘城故城（本地俗称北旧城） 汉代——明代 汉代始建
编号：7-0330-1-330 古遗址类 大运河商丘南关码头遗址（睢阳区） 隋至宋
编号：7-0611-2-095 古墓葬类 徐堌堆墓葬群（梁园） 东汉
编号：7-1798-5-191 近现代重要史迹和代表建筑类 商丘淮海战役总前委旧址（睢阳） 1948年
本次申请的与此前公布的全国重点文物合并一处：大运河
加上前些年公布的归德府古城墙、永城芒砀山汉墓、宋城遗址、王油坊遗址、柘城李庄遗址、圣寿寺塔、崇法寺塔等，目前我市国家级重点文物保护单位应该已突破15处。这与它第二批全国历史文化名城的身份是相符的。