“那位先生”（あの方）
　　姓名：不详
　　性别： 男
　　年龄：不详
　　简述：“那位先生”即组织内成员对黑衣组织首领的称呼。但黑衣组织首领的身份一直是一个谜，即使在漫画中也从未以组织首领的身份露面或者有过一个剪影。现在已知他所“宠爱的女人”（GIN语）是苦艾酒。此外，在425 Black impact ！被组织的魔掌触碰的瞬间中曾提到，他下令苦艾酒协助暗杀任务。而且，组织的首领手机号码在鸟取县（TV387 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音 尾奏曲 ）中由于苦艾酒的电话被窃听，从而得知，但因其危险性，被哀劝阻，所以柯南并没有拨打此号码。据说作者青山刚昌曾经在2006年的一次访谈（《朝日新闻》2006年1月13日晚刊）中指出组织的首领其实是之前的漫画中出现的人物，并得到了大部分柯南迷的支持，且由此产生了一些猜测。
　　初登场：未知，存在是否已登场的疑问

gin 代号：琴酒 （GIN ジン）
　　姓名: 黑泽阵(在''人鱼失踪记''和漫画中曾出现）(猜测）
　　性别：男
　　年龄：28-38(预测）
　　简述：琴酒是组织中最早出现的人物，Vodka的大哥，新一就是被他从背后打倒，再灌下了毒药APTX4869。他的年龄、国籍和真名都是一个谜。永远都是一身黑色长风衣，黑色的帽沿下披散的银色长发，和一张总是那样邪恶的脸。残酷无情，极度冷静，有着冷酷的眼神，右眼闪着寒光，杀过许多人也不在乎的样子，在组织里似乎有极高的地位，只要达到他的地位就可以见到“那位先生”，主要负责很危险的暗杀和重要交易。和雪莉似乎有很深的关系，是个智能型的罪犯，和柯南多次交手都只吃过一次亏（M13 柯南用灯罩【而这个灯罩是被直升机扫射时击中，掉在柯南身边的】把他乘坐的直升飞机打了下来）。有一辆从德国买来的黑色保时捷，型号是356A，左撇子。貌似被贝尔摩德喜欢,但具体暧昧情节在动画版中删掉了。
　　劲敌: 赤井秀一(已失踪或已死亡)、工藤新一(江户川柯南)
　初登场：漫画：Vol.1 File.1 《平成的福尔摩斯》TV：001 云霄飞车杀人事件

C

啊啊 琴酒琴酒

代号：伏特加（Vodka ウォッカ）
　　姓名：不详
　　性别：男
　　年龄：不详
　　简述：琴酒的助手，也是早期登场的人物，GIN的贴身助手兼司机。新一当时便是目睹了他和不名男子的交易。Vodka长的非常壮，头脑简单，遇事没有主见，做事稍嫌不细密，全听琴酒的，尊称琴酒为「大哥」。有几次险些中了柯南的计而暴露组织的情况，幸由琴酒发现而得以弥补.
初登场：漫画：Vol.1 File.1 《平成的福尔摩斯》TV：001云霄飞车杀人事件

代号：龙舌兰（Tequila テキーラ，死亡）
　　姓名：不详
　　简述：组织人物之一，关西口音的大汉，在一次在和满天堂公司职员交易的时候因拿错箱子在与GIN通话时被误炸而死。曾与电脑工程师板仓卓接触过。

插

代号：卡尔瓦多斯（Calvados カルバドス，死亡）
　　姓名：不详
　　简述：组织人物之一，似乎是苦艾酒的助手，是个枪法很准的狙击手。所持来福枪、手枪、猎枪等各种武器。最喜欢用的是来福枪。原因：直面黑色组织的对决！满月之夜的二元神秘事件中，贝尔摩得说“用你最爱的来福枪……”。头次出场带着3把枪，之后就被赤井秀一打断双腿.然后在自己被捕前自杀了。真是个倒霉的家伙，连个面都没露，连句话都没说出来……不过在2006年的SP TV425 黑色冲击！组织魔爪伸来的瞬间 中，在组织成员chianti和korn的回忆中出现过一个剪影，大约是一个戴眼镜的瘦高个子。
　　初登场：漫画：File.433 《面具下的真相》TV：345 直面黑色组织的对决！满月之夜的二元神秘事件

代号：基安蒂（Chianti キャンティ）
　　姓名：不详
　　简述：组织的优秀狙击手，狙击上限为650yard。因为苦艾酒的行动害死了卡尔瓦多斯，对她非常反感。
　　初登场：TV： 425 黑色的冲击！组织魔爪伸来的瞬间

代号：科恩（Korn コルン）
　　姓名：不详
　　简述：组织的优秀狙击手，和基安蒂是搭档，射击能力也与她不相上下。似乎和之前死去的卡尔瓦多斯关系很好。同样反感苦艾酒。

后排坐定

代号：波本（Bourbon バーボン）
　　姓名：不详
　　简述：谜一样的组织成员，对他的认识之少可以说仅次于那位先生。最早的“登场”来自于水无怜奈在返回组织后给FBI的一通电话中。水无怜奈提到组织为寻找雪莉而派出了强大的侦探。这名侦探很可能是组织高层人物，但是连水无怜奈也没有听说过，而他的代号就是波本（Bourbon ，一种烈性美国威士忌）。在随后的漫画中，可以感受到波本已经出现在柯南的周围。但并没有被明确地指出。有人认为赤井秀一死后忽然出现的大学生冲矢昴就是波本，因为冲矢昂暂住在新一家里，在TV511中最后他有喝Bourbon，而且露出神秘的笑，但他也可能是赤井秀一假扮的。也有人猜测，失踪后又再次出现的秀一才是真正的波本。因此，这个人物虽然应该已经出现过了，但他究竟是谁还是一个谜。
　　初登场：TV：509 红白黄色与侦探团