建安十二年(公元 207年)，曹操大封功臣。夏侯敦增封邑一千八百户，并前共二千五百户。
建安二十年(公元 215 年)，夏侯敦又率军从曹操攻汉中张鲁，克之而还。
建安二十一年(公元 216 年)，夏侯敦随曹操东征孙权，孙权退走。
建安二十二年(公元 217 年)，三月曹操引军还，留夏侯敦都督曹仁、张辽等二十六军屯居巢(今安徽桐城)，以镇淮南，防备孙权。曹操并赐夏侯敦”伎乐名倡”，以示优待，令曰：”魏绛以和戎之功犹受金石之乐，况将军乎！”
时曹操以魏公置官属，“诸将皆受魏官号”，为遮人耳目，夏侯敦名义上仍为汉朝官属。于是他就不能对曹操称臣朝拜，这使尽忠于曹操的夏侯敦耿耿于怀，他多次上书，“自陈不当不臣之礼”，坚决要求授魏官号。后来，曹操封其为魏国之前将军。
建安二十四年(公元 219 年)，关羽围曹仁于樊城，尽歼于禁精锐援军，威震华夏。曹操率军南下，同时令夏侯敦率淮南军主力驰援，夏侯敦军与曹操会于摩陂，诸军击败关羽。
此时曹操对夏侯敦特别亲重，常与同坐一车。敦有事可直接出入曹操卧室，其地位明显高于其他将领。战后，夏侯敦被仍统诸军还镇淮南，屯寿春(今安徽寿县)，后徙屯召陵(今河南郾城)。
建安二十五年(公元 220 年)，曹操病逝，曹丕继位为魏王，任夏侯敦为大将军。数月后，敦病逝。谥曰忠侯。
余论
夏侯敦虽为武将，却虚心好学，亲迎老师到军营为其授课。他居官清廉，生活俭朴，关心属下兵民疾苦，有余财，辄接济他人，而不为己治产业，故在军队和地方上均有相当的威信。他作战勇猛，屡立战功，军事才能虽非卓绝，但因系曹氏宗亲，为同患难的首义之臣，又矢忠于操，故一直被重用，委以重任。
文帝曹丕追念敦的功绩，欲使其子孙毕侯，分敦邑千户，赐敦七子二孙皆为关内侯。在此之前夏侯敦的弟弟夏侯廉和次子夏侯茂已经封了列侯。曹操将女儿清河公主下嫁夏侯茂，茂历官侍中、尚书、安西、镇东将军，假节钺。
