NO.6 詹姆斯-布莱克
作为赤井秀一和朱蒂的上司，FBI探员詹姆士也有些奇怪的地方。例如在他初登场时，柯南注意到他的名字和莫里亚蒂教授同名而且生于伦敦，同时又来自曾经黑帮横行的芝加哥，而姓氏恰恰是英语的单词"黑"（全名James Black 詹姆士.布莱克）。之后詹姆士也有一些奇怪的行为，使人产生一些联想。

出生于英国贝克街（就是福尔摩斯住所的所在街道），而在美国芝加哥成长。跟赤井秀一是旧识，认识朱蒂，似乎是FBI的长官之类的人物。姓名不知道是不是化名，不过令人很在意。灰原注意到的是「Black」，而柯南在意的则是「James」。 但不是詹姆斯·邦德那个007 而是夏洛克·福尔摩斯的宿敌詹姆斯·莫里亚蒂教授。

NO.8 Mr正影
照片暂无
青山刚昌笔下《名侦探柯南》人物之一。案件中提到的失踪名魔术师，可能与盗一有关。据说现在仍然活在某个地方，是黑衣组织BOSS怀疑对象之一。

NO.9 琴酒

自编自导自演的可能性还在啊

然而，要作为一个如此庞大，神秘的组织首领，他必须要满足以下条件：
1.头脑绝对要聪明，实力派，不可能是个白痴来统领Gin,Vermouth这些人精
2.有很强的经济实力。如此庞大的组织要运作，要研发新的科技，没有庞大的资金支持，组织可能会支持到现在吗？
3.很可能是日本本土或者在国际上很有地位的人。组织中有两位成员，Pisco 升山宪三和吞口重彦（没有代号），一位是财经界巨头，一位是政客，那么首领自然不会是一个平庸之辈。而且Gin在枪杀Pisco 升山宪三时说过，他是依靠组织的力量才拥有今天的成就，这也证明了组织的庞大，超强的实力。
而纵观整个名侦探柯南+魔术快斗（73的另外一部作品，主角为黑羽快斗，即怪盗基德），有可以被怀疑为黑衣组织Boss的实力的人物---黑羽盗一（已失踪）、工藤优作、本堂瑛佑（大智若愚）、冲矢昴，黑羽快斗、赤井秀一、阿笠博士、灰原哀、妃英理、Gin、贝尔摩德、毛利小五郎、服部平次，詹姆斯布莱克及柯南！

那么还剩下谁？
工藤优作、黑羽盗一、阿笠博士、詹姆斯布莱克和毛利小五郎。
先说说工藤优作、黑羽盗一与Vermouth的关系：
优作是有希子的丈夫，有希子贝尔摩德同门学艺，优作和贝尔摩德熟识也是有可能的。
在工藤新一纽约事件中，我们得知有希子和贝尔摩德是在一个著名日本魔术师手下成为同门师姐妹，这个魔术师教会了她们化妆术，并多教了贝尔摩德一项技艺：变声。所以当沙朗（即贝）成功地化妆为警长替有希子解了围。
这样一个会变声的魔术师是谁？难道不是黑羽盗一吗？
这样一想，黑羽盗一便存在着许多嫌疑。
他是宠爱贝尔摩德的，否则不会只教给她变声术，却不教给有希子。
组织boss的邮箱，和“七子之歌”这首歌有关。其中的信息指明了乌鸦，乌鸦的羽毛是黑色的，自然是黑羽。 而且，有一个细节可以参考。柯南是在“奇异屋宇的大冒险”这一集的开头发现boss邮箱秘密，而在这一集的结尾，怪盗基德意外现身，或许是青山有意埋下的伏笔.
在漫画《魔术快斗》的第一集当中，黑羽快斗在17岁的时候发现了父亲的密室,知道了父亲的秘密.而这里面有一个明显的问题，盗一是被人杀死的，那为什么会有这个密室里面那盒说明自己基德身份的磁带？难道盗一未卜先知，知道自己会被人杀了，所以提前做好准备？
还有就是盗一化身基德的服装也是黑色的，与黑衣组织的统一黑色服装一个颜色！！！
基德所要对抗的那个组织如果和柯南寻找的黑衣组织是同一个。那么问题就再次出现，组织的一贯以心狠手辣著称，可却唯独放过了快斗。本该死了八年的人，再度复活，粉丝把街道都围的水泄不通了，组织居然无动于衷，让人费解。
怪盗基德被称之为“平成时代的亚森罗平”。亚森罗平是莫理斯·卢布朗笔下的侠盗。而在《怪盗亚森罗平》这本书中，他的父亲泰奥弗拉斯特·罗平并不像儿子想象的那样是个正人君子。
从“工藤新一小时候的冒险”中，我们发现黑羽似乎是一个很冷冽的人，鬼鬼祟祟潜入图书馆，给新一下战书，并用匕首把战书钉在墙上，不能不说这是一种诡异。
盗一一开始就很少正面出现，73也未明确盗一已死，只是失踪，另一部漫画《魔术快斗》里，说快斗的父亲是因为一个黑衣组织才销声匿迹，可能是他通过这个组织把自己隐藏起来，只是失踪了一样。
不过盗一是另一部漫画中的主要人物，将自己创作的别部漫画中的人物来作为大作《名侦探柯南》中的最终BOSS，总觉得不大合乎常理，不过也不排除“借尸还魂”的可能，众所周知，《魔术快斗》首次刊登是在昭和62年SUNDAY26期上，自那以后在SUNDAY本刊或增刊上时有刊登，是不定期连载作品。直到2009年6月的现在还是未完成作品。且未曾发行过TV动画。正因如此，也可以清楚的看出青山老师的画风变化。而《名侦探柯南》中大量引入怪盗基德、黑羽盗一、中森银三、白马探等角色，似乎有将两部作品同化之嫌，怪盗基德 的生日与青山刚昌的同属一天，更看出青山对《魔术快斗》难以割舍的感情，所以盗一作为最终BOSS可能性最大，尽管这样可能会使纯柯迷们大为不满。
作为黑羽盗一的朋友的工藤优作，推理能力如此之高。却在盗一死后八年，仍然没有找出盗一死亡的真相，而且他好像似乎根本不在乎这个人了，难道另有隐情？
工藤优作具有超过柯南的推理能力，还有在美国的神秘生活。组织磁盘中存有以他作品主人公相似命名的“暗夜男爵”病毒，还有他的妻子有希子是组织成员Vermouth的好友。种种迹象表明，工藤优作和组织似乎也有一些瓜葛。另外柯南每每能够在与组织对抗的绝境中不可思议的逃生，是不是因为组织成员得到优作的授意不得伤害柯南呢？另外，灰原哀的那句话，“你（新一）早在半个世纪前就在组织的计划中了”也让人颇费思量。半个世纪前，新一肯定没出生，那就只能证明组织和工藤优作有着某种联系。（半个世纪就是50年，优作才39～45岁，50年前也没有他吧？）唯一的问题是，如果真是这样，为什么Gin又要灌他儿子的毒药呢？
PS:官方也已经否认阿笠是Boss（见于2011年10月28日更新的《少年Sunday》官方博客）。所以“阿笠博士是幕后Boss”是彻头彻尾的谣言！官方都已经否认了，所以阿笠博士等于BOSS不成立，官方否认的！请各位柯南迷不要听信网络流传的

如果我没记错的话，服部的原型是《福尔摩斯》里的一位黑皮肤、高个儿侦探（擒拿专家），在《退休的颜料商》里曾与福尔摩斯在查案时相遇，然后联手（就出现过这一次）
福尔摩斯原话：“他办过几件漂亮的案子，办事方法和我相同，不过很管用。”
从书中可看出这位侦探和福能力相当，应该就是服部的原型了，凭此可证明说服部是Boss几乎是搞笑了

服部是boss= =好意外

0.0服部是BOSS？!
肿么可能……

说是服部平藏还多点人相信

话说我觉得服部平藏和服部平次 很有可能……

话说我觉得服部平藏和服部平次都很有可能……

我会说我看的笑尿了么噗哈哈

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