闯王 在商洛山中时与十八骑将各自家人全部杀死。李家血脉只剩他的侄儿李过 而李过为十八骑之一,妻儿已死,只余一养子李来亨。闯王死后,建奴势大,顺军连战败北,南明无兵无将,张献忠身死,于是顺军与西军孙可望、李定国余部共卫南明。李过、李来亨随李定国转战湘、桂五年。后军中疫病流行,李过水土不服,病殁。
孙可望在永历十四年从贵州引兵入云南,攻定国,又悍然围攻由贵州入蜀的高必正、党守素、贺锦、李来亨部,只有李来亨力战得脱,高必正等均被杀。李锦、高必正相继殉难后,李来亨毅然摆脱南明永历政权的羁绊,率领数万部众自贵州进入川、鄂边境,同先期到达的郝摇旗等部会师,并联合当地其他反清武装,组成了夔东十三家军。康熙元年(1662),清廷调集三路大军,围攻夔东十三家军。李来亨等指挥将士奋勇作战,屡败清军。此时,各地抗清武装先后失败,郝摇旗、袁宗第等先后阵亡。李来亨孤立无援,只能据守险峻的茅麓山。康熙三年八月,清军利用叛徒引路,乘雾从后山偷袭,由于力竭矢尽,李来亨举家自焚,十三家军覆没。