①上皮损伤：由于结石的活动和管壁的蠕动，更易对输尿管黏曱膜造成直接损伤，发生黏曱膜上皮充曱血、水肿、坏死和脱落，并形成溃疡及炎性纤维增生，管壁增厚，管腔狭窄。
　　②尿路梗阻：由于输尿管管腔狭窄，而且还有生理性狭窄，小的结石很容易在这些狭窄部位停留造成嵌顿。输尿管结石很少会造成完全梗阻，由于结石通常为不规则的枣核形状，所以尿曱液一般可以从结石周围通过。依身高的不同，成人输尿管全长大约22～30cm不等。
　　输尿管的直径不一，解剖上有3个生理性狭窄：肾盂输尿管连接部内径约2mm；输尿管跨越髂血管处内径约4mm；输尿管膀曱胱连接部内径约3～4mm。输尿管较为a狭窄的部分是通过膀曱胱黏曱膜下通道进入膀曱胱的部分，即输尿管膀曱胱壁段。输尿管可分为腹部和盆曱腔部，腹部指从肾盂到髂血管处：盆曱腔部指从髂血管处到膀曱胱。上述3个狭窄部分是泌尿系结石在下降过程中，较为a容易发生梗阻嵌顿之处。
　　③继发感染：在结石部分或者完全梗阻时容易发生，由于结石损伤输尿管黏曱膜甚至造成溃疡，降低局部组织对感染的抵抗力，常常在嵌顿的部位发生输尿管炎及输尿管周围炎。由于输尿管炎性纤维增生和管壁增厚，使管腔狭窄严重，加之结石与黏曱膜的炎性粘连，结石更加不易排出。后期随着炎症的加重和蔓延，还可能产生严重的肾盂肾炎，加速肾脏损害的进程。少数患者由于严重的化脓性曱感染，结石可能自行穿透输尿管壁排出腔外，并且出现尿外渗。