了防范使徒再来，真嗣进行着EVA的操作训练，同时也转学到第三新东京市的学校就读。在上课时，老师讲到第二次浩劫的历史事件。可是同学们都不专心，在台下偷偷的玩用电脑网络聊天。真嗣被套出他是EVA 驾驶员，在班上立刻成为受欢迎的人。但同班的铃原东治却对他大打出手，这是因为他的妹妹在EVA 与使徒的战斗中受牵连而受伤。不一会，第四使徒来袭，真嗣将从避难所里出来观望的东治与剑介救入驾驶仓，并无视美里的撤退命令，用高振动粒子刀击退了使徒。
　　 真嗣的生活因为当了EVA的驾驶员而起了巨大的变化，但在某些方面，他亦反而受到遣责，就象许多其他剧本中的为了人类而战的主人公们，他们的存在反而被人们视为威胁一样。第四使徒是被真嗣独立消灭的，但没人会认为他是什么热血沸腾的救世主，反而的，出于他消极的观念对所处环境进行的反抗，倒给人留下了深刻的印象，这种思维方式，相信很多人亦有同感吧。
　　 副标题中的transfer解释方式有很多，但在这里译为转校生最为合适。要表达的意义，是所处在一个陌生的集团中的那种不安感。