此后,樱直到一周之后,大结局的时候才再次出现。
↑UBW线 †
还是路人。
前三天和fate线情节一样。第三天,和Fate线一样,樱说星期六和星期天都无法去卫宫家。
第四天,士郎领著saber去学校参观,在弓道社看到了樱,士郎邀请樱晚上去卫宫家吃饭,樱很高兴地答应了。
晚上的时候,樱被藤姐拉著一起住在了卫宫家*4,晚上三人住在同一个房间。
第五天,由於凛没有提出和士郎联手的提议,因而也没有住进士郎家。樱和藤姐、Saber三人又一起住在卫宫家,睡在同一个房间。
第六天,士郎在学校看到了慎二,慎二提出和士郎联手对付凛,但被士郎拒绝,慎二随即提出士郎既然要加入圣杯战争,卫宫家就太危险了,以后会禁止樱再去士郎家。其实是慎二害怕士郎将樱抓去当人质,士郎同意了。
当天晚上慎二就打电话将正在卫宫家做饭的樱叫了回去。此时可选择去间桐家看樱,和樱在间桐家外面相遇,樱会告知士郎短时间内无法去卫宫家。
第八天放学后,可选去间桐家看樱,但遇到了凛,凛告知士郎,樱还因为学校被袭击的事躺在医院。
此后樱直到圣杯战争结束之后,在结局之中才出现,忙於照顾治疗中的慎二,圣杯战争结束一个月来只有周六周日她才会来到卫宫家。士郎曾有一次偷偷观察他们两个的情况,不知为何看起来相处得不错。
这条路线应该是樱的结局最悲惨的一条线,看起来是要和慎二一起度过余生,因为樱十一年一直受到虐待,间桐家从没有人对她说过温柔的话语,所以慎二那种恶劣的对待对樱来说竟然也成为一种温柔。
HF线 †

士郎得知慎二是master之后,为了保护樱,让樱搬入了卫宫家。
在两人相处的过程之中,士郎慢慢发现了自己对樱的感情,樱也对士郎说出了自己的爱意。
对士郎又嫉又恨的慎二挟持了樱,命令士郎一个人赶去学校,在那里慎二命令Rider和士郎对打,试图将士郎置於死地。
Rider在战斗之中放水,士郎和赶来的凛、Archer也因此救出了樱
慎二逃跑时,让樱的耳环洒出了媚药,刺激了她体内的刻印虫,众人也因此得知了樱才是间桐家真正的Master,以及樱的身体在过去11年之中所遭受到的凌辱和虐待。
因为身体被改造为伪圣杯,在吸收英灵的过程之中,樱做为人的技能逐渐丧失,同时污染圣杯的黑暗力量也影响著樱,让她在夜晚睡著之后以梦游的形式,出外袭击路人。
为了维护被刻印虫撕咬的身体,卫宫士郎夜夜与樱补魔
Saber被樱吸收之后,成为黑化Saber。
间桐脏砚利用了樱心中隐隐约约的对姐姐凛的羡慕和嫉妒,使得樱内心的弱点极大化,最终在慎二试图再次在床上侵犯樱的时候,樱跟黑影同化杀了慎二。
黑化之后的樱吸收了众多Servant的灵魂,被世间所有的恶所控制,成为黑色圣杯的化身。她来到柳洞寺地下的大圣杯前,召唤世间所有的恶的降临。
被击败了脏砚后的言峰指出“根本就没有黑樱”,而是樱为了保持自己受害者的身分而创造出来的假人格。樱当场发火爆了言峰的心脏,似乎所言不假
最终,得知一切的士郎放弃了成为正义的伙伴,选择了保护樱。他和凛、Rider*5赶往柳洞寺地下试图救出樱。黑化Saber出现,拦住了士郎和Rider,放凛一个人赶去樱那边。
Rider和黑化Saber对决之时,士郎投影出伪·螺旋剑和盾牌,击败了黑化Saber,随后赶往大圣杯,投影出破除契约之剑,斩断了樱和黑影的联系,让Rider救出樱和凛。
Normal End(樱之梦):
士郎用尽最后的魔力投影出黑化Saber的被约定的胜利之剑,毁灭了圣杯,自己的身体也因此破碎,形神俱灭。
樱卖掉了间桐家的房产,买下了卫宫家的房宅,明知士郎已死,却依然为了守住两人一起去赏花的约定,孤单寂寞地留在卫宫家中,日复一日地等著士郎的归来,直到生命的尽头。