刚开始宇宙中有最完美的种族娜迦族，他们就像是泰坦巨人一样，他们自由快乐地生活着；
娜迦族每过一段时间就会引导精神能力最强的种族和肉体能力最强的种族融合，从而把“泰坦”的接力棒交给下一个种族；
有一天，娜迦族中出现了一个背叛者（类似萨格拉斯），他不想交接力棒了，他想永久统治宇宙，所以他开始挑起Zerg对娜迦的攻击，导致娜迦灭族；
娜迦灭族以后，背叛者开始按照自己的方式重建秩序，其中重要的一部就是野蛮地操作Zerg和Protoss的融合。与娜迦不同的是，背叛者创造新种族的原因不是为了交接力棒，而是把它当作自己的爪牙；
随着剧情发展，了解到这一切以后，Z\P\T结束多年的征战，开始联手准备对抗燃烧军团的入侵，其中娜迦神殿可能是抵抗入侵的关键；
最后背叛者萨格拉斯带着燃烧军团入侵了，Z\P\T经过努力奋战，勉强抵抗，但最终不敌；
萨格拉斯带着满意的笑容走向娜迦神殿，吸取生命之树（神殿）的力量，突然无数的先祖之魂小精灵（可能是残留娜迦势力）出现，开始绕着萨格拉斯放技能，最终生命之树（神殿）爆裂，萨格拉斯也死了，世界恢复平静；
Z\P\T联盟也就此结束，开始对新一轮秩序领导权的争夺，而燃烧军团也在酝酿着下一次的入侵（下一次是阿克蒙德领导的）。