1996年11月11日 37 动画原创 仙人掌花杀人事件
侦探所来了一个奇怪的委托人，说自己暗恋想寻找的人，可是柯南通过画像的畸形肯定她是痛恨此人。委托人遗忘了手绢，柯南借机在她家中找到了一丝线索。柯南随后找到了委托人的复健师，知晓了她和男友遭遇车祸，男友去世的事情。明白了委托人复健神速和找人的原因，在千钧一发之际，带着她男友最喜欢的象征生命的仙人掌花阻止了悲剧。
1996年11月18日 38 Vol.2 红鬼村火祭杀人事件
毛利受委托监视一名说有自杀企图的人，后来该人被发现被火祭烧死。通过照片中左撇子与右撇子的区别，柯南发现这是一起骗保险金的故意杀人事件。而犯人就是委托人，并且他完全不认罪，柯南险些遇难。最后，用强力鞋狠狠地教训了这个自私的凶手。

1997年3月10日 51 动画原创 高尔夫练习场杀人事件
毛利三人组在早上去高尔夫球场，遇到了爆炸事件，在毛利旁边位置打球的某社长被炸身亡。现场的情况开起来像是球杆被替换过后导致的，但柯南深入高尔夫球场，找到了证据，指正了犯人。
1997年3月17日 52 Vol.11 雾天狗传说杀人事件(1小时特别版)
由于毛利大叔迷路车又爆胎，三人组被迫去山中的寺庙过夜。不料寺庙里住着的主持是个神经兮兮的人，还不断用雾天狗的传说恐吓兰。寺庙的一大特色是后山的瀑布会有一部分流入寺庙的走廊，伴随着飘下的花瓣十分风雅。晚饭时，微醉的主持一听到其他弟子求毛利解答2年前的事件时大怒离去，第二天却同两年前的另一位弟子一样的情况下离世。地点是足有4米高的偏房，最下面的墙壁破了大洞，主持被吊在上面的衡量，看起来像是自杀。柯南确认为，自杀绝不可能用斧头在墙壁上看出大洞，于是到下游寻找证据，终于破解的真相。原来犯人是秀念师父，他为了替哥哥报仇，也就是2年前，被主持用同样手法杀害的忠念师父。犯人利用的是水的浮力。最后，秀念说，如果毛利侦探两年前就造访了这间寺庙就好了，引人深思。


1997年4月21日 55 动画原创 列车圈套杀人事件
毛利三人组乘坐的列车上发生了杀人事件。柯南发现一人持有大量硬币，并用手擦扣子，行为
可疑。被害者身上有针头注射过的痕迹，并且嫌疑人身份是医生，调查之后，发现该人正是是凶手。他利用列车的出发时刻和形式录像作案。
1997年4月28日 56 动画原创 清洁公司杀人事件
一家清洁公司旁发生了坠落物伤人事件，由于被害人是清洁公司员工，所以警部去向社长询问情况。柯南发现社长按下奇怪的开关，并且**赶来前叫助手开走并不碍事的清洁车很可疑。随后他在顶楼发现了摄影机和被细线划过的痕迹，确定了凶手就是社长。


1997年5月5日 57 Vol.12~13 福尔摩斯迷杀人事件（上集）
1997年5月12日 58 Vol.12~13 福尔摩斯迷杀人事件（下集）
柯南极为兴奋的报名参加一个福尔摩斯迷聚集的旅游团，并随队到了海边悬崖上的别墅。主办人金谷欲之宣布了比赛规则：不借助工具回答1000道题，到第二天晚上前做完并达到990分，优胜者得到初版真品书。不仅柯南，考虑到喜爱工藤新一也可能出现的服部平次也来了。在柯南彻夜兴奋的做着问题时，大家不知道，主办人失踪了。等到第二天夜晚，忽然有人看到外面主办人的车子开向悬崖。服部和柯南追了出去，途中车子还加速了，里面的主办人不论服部柯南如何大喊都不停车，最后坠崖身亡。大家害怕的聚在一起时，忽然叫绫子的女士表示想出真凶，但给众人10分钟思考时间，自己去了厕所，出来后，却改口称考虑失误。不久，车库传来爆炸声，绫子被烧死在里面。这时，藤泽先生贡献出了一张主办人留言的纸条，启发柯南服部破解了车库爆炸之谜。众人聚在大厅，忽然停电，黑暗中有人袭击藤泽，又有窗户破碎的声音，看似凶手已逃到窗外。但实际上，这个行为反而暴露的凶手就是户达先生。
同时，服部对柯南的身份和毛利能忽然破案产生了怀疑，为避免被他撞破，柯南只能将麻醉针射向他。这也让服部确定了柯南就是工藤的事情。服部成为第四个知道真相的人。
1997年5月19日 59 动画原创 第一次购物的杀人事件
米花商店主办首次上街购物大赛，参赛的都是小朋友，他们要买齐手中单子上的全部物品。少年侦探团自告奋勇当起现场转播员负责父母不在身边的小弘。柯南发现小弘买东西的路线很奇怪，既不是按顺序，也不是按距离的远近，而是好像挑些物品在买。途中，小弘多次遇到险情，有人隔断绳子使绑在车上的中午滚落，又把车子的手刹车取消。柯南努力的化解了危险后，小弘却失踪了，从他丢下了无比重要的玩具，柯南判断他被抓了。柯南通过线索，找到了小弘被关的位置，石洞废弃了的大厦，不料发现小弘的同时也发现了尸体，柯南明白小弘被多次暗杀的原因，这是凶手出现封死了出口。外面，拆迁的机车已经开始敲击大楼的墙壁了！
众人放弃希望时，柯南坚信会出去，这时墙壁内的水管爆裂，让众人找到了下水道，借此逃出废弃大楼。
柯南指认凶手后，小弘醒来，问凶手买东西。原来凶手是曾经这里的杂货店的老板，他之所以目睹杀人场面，是因为想来这里买东西，他从来都记得这家生意差到倒闭了的小店。老板倍受感动自责的留下了泪水。

1997年5月26日 60 Vol.13 插画画家杀人事件
毛利受邀为著名插画画家的新作题名，却苦等良久。随后该画家出现，并接了奇怪的电话，不久，电话的打来者蝶野小姐从办公室对面的大楼坠落。柯南通过死者严重的隐形眼镜和坠落的框架眼镜还有偶然回来取忘记的东西的快递员的话发现了真相。