2000年9月,四川大学在国内率先启动了拔尖创新人才培养试点工作——“四川大学创新人才综合培养计划”,这是国内研究型大学对拔尖创新人才培养模式的较早探索;在此基础上,2006年6月成立了吴玉章学院,是对优秀本科生实施“拔尖创新人才培养”的荣誉学院。现任院长是四川大学校长、中国工程院院士谢和平教授。吴玉章学院的学生是在当年入学的新生中严格遴选录取的(录取比例约占每年新生总数的1.5%),学院对学生实行“滚动淘汰制”管理。学院重视创新人才培养,不拘泥于科系的限制,坚信创新的动力来源于丰富的交叉课程学习。所有学生进入吴玉章学院后,一、二年级进行大类通识教育,主要修读校级模块课程、院级素质教育模块课程和学科基础模块课程,大部分的课程采用双语教学,学生从大一下期开始进行研究能力培养,参与导师研究课题。三、四年级实行宽口径的专业教育。每位学生配备一名高水平教师担任导师。在导师指导下,根据个人专长、兴趣爱好和专业要求等,制定“一人一个”培养计划;同时为学生设立专项科研基金和小科研项目,提供早期进入科研训练的机会,借阅图书资料、进入国家重点实验室等享受与研究生相同的待遇,并设立专项奖学金或提高获奖学金人数的比例,优先、多渠道提供学生赴海外知名大学留学或实习的机会,保送免试研究生比例高于50%,顺利毕业的学生将授予吴玉章学院荣誉证书。