刘璋时期，益州本土和外来士族矛盾很深。刘备入蜀后只能略为改善。
【封亮武乡侯，开府治事。顷之，又领益州牧。政事无巨细，咸决于亮。】诸葛亮独掌内外事后。为稳固蜀汉政权，开始大量重用本土士人。如张裔、杨洪、马忠、张翼、张嶷、李恢等。至使巴蜀士族占近半数，而荆派只占三成余。于是益州本部人开始拥护诸葛亮。
可是，连年征战，巴蜀人就开始生厌，至使朱褒、雍闿、冬逢、隗渠反。 诸葛亮于是再不敢让巴蜀旧人掌实权，尤其最高的领导层，抓的极紧。
这可以从诸葛亮用李严一事上看出。李严是巴蜀领袖，"刘璋以为成都令，复有能名。"而刘备入蜀时，"严率众降先主，先主拜严裨将军。成都既定，为犍为太守，兴业将军……章武二年，先主征严诣永安宫，拜尚书令…… 与诸葛亮并受遗诏辅少主。"
李严有才干，更是托孤重臣。但到诸葛亮时却不予重权。"以严为中都护，统内外军事，留镇永安。"，不让他参与中央决策。杜琼"为人静默少言，阖门自守，不与世事。"却被"拜为谏议大夫，迁左中郎将，大鸿胪，太常。"刻意让巴蜀士人不能展其才。王平大才，却要到蒋琬时才能大用。诸葛亮以此等手段让荆派掌蜀汉领导权。
自荆州失落，蜀汉本来应该极力栽培巴蜀人才。诸葛亮却早早定下继任人，蒋、费、董，数十间，巴蜀士族虽能入士，却不能进入中央领导层，更常被错用以制其才。
诸葛亮初衷或者是要平衡荆益双方，让荆派人少但掌权，益州人多难近中央。然而这间接令荆派后期排异。姜维等有志却难申。