首先《大航海时代》网络版最直接、最简单的一个优点，就是游戏容量要比单机版大很多很多倍。网络游戏的回报和单机游戏不可同日而语。无论是游戏的系统，还是游戏的世界，《大航海时代Online》都要比任何一集《大航海时代》的单机版要庞大得多。游戏世界没有开放完全，自然是留给以后公布资料片之用。还有一点很重要的是，《大航海时代Online》是该系列历史上第一次使用全3D画面的游戏。经过《真？三国无双》等游戏的锻炼，光荣公司在3D技术上的实力已经非常成熟。《大航海时代Online》的游戏画面在同类游戏中属于中上的水平。
然后《大航海时代》一直都是角色扮演游戏，《大航海时代Online》的游戏系统和单机版本的差别并不大，原有的游戏系统很多都被继承到《大航海时代Online》里。在《大航海时代Online》中，熟悉该系列的玩家可以有很亲切的感受。
还有最重要的一点，就是《大航海时代》网络版中玩家交流的问题了。沉浸其中最大的快乐，就是能和好友们共同航行在同一片海洋里。网络版实现了这样的愿望。能够尽情体验《大航海时代Online》的众多优点，又不用忍受某些玩家的骚扰，最关键的还是要看玩游戏的心态。首先如果你是《大航海时代》系列游戏的忠实玩家的话，那么自己不要抱着功利的目的游戏。然后在游戏中，选择性地交友，对于道不同的人，远远地躲开他就可以了。适当的选择自己的游戏方式和社交范围，就是能尽情体验《大航海时代Online》的必杀秘籍。
总之从游戏系统上考虑，网络版拥有着无可置疑的优势。至于游戏方式是否能让人习惯，那就看玩家自己的游戏态度了