这次事故是D301撞上了D3115，造成D301追尾，D301列车第1至4位车厢脱轨，D3115列车第15和16位车厢脱轨。
首先要帮助大家理清几个事实！
1两辆列车停靠的最后一个车站是温州境内的永嘉站，D3115先发车，D301后发车。按理来说，应该是D301先发车 D3115后发车，他们搞反了！按照D301次和D3115次列车的正常时刻表，D301次在永嘉站并不停靠，而是会直接通过。但是却停靠了永嘉站，为什么会停靠？就是因为雷雨天气导致的“非常站控”。
2当时因为雷雨天气，永嘉站及邻近站，已经进入了“非常站控”此时，列车脱离系统控制，进入传统的车站人工控制模式。这标志着指挥列车行进的指令，从电脑自动生成转为人工下达命令。这就是为什么D3115动车晚20分钟出发，列车出发启动比一般时候更慢，出发一段时间后，列车开始减速了，减速过程持续一分多钟左右，并没有停止。
3 D3115动车慢速行驶双屿境内，被D301以100公里/时（急刹车后的速度） 撞上。有一个疑问，列车的所谓三大防护系统为什么没提示，失灵了吗？CTCS-2系统包括列车
自动防护子系统(ATP)
列车自动监控系统(ATS)
列车自动运行系统(ATO)三个部分。
我可以告诉大家，列车的防护系统因为雷雨天气只有部分出问题（比如自动改手动），正是防护系统的提示警告，调度站才要求D3115列车停止，他们原本以为是 D3115快要撞上了D301列车，没想到正正是因为调度站的失误，错误指令导致了追尾的发生。
最终的事实就是：调度站错误的判断D301驶在前，D3115 驶在后，在防护系统的提示下，下令 D3115 慢速运行防止追尾！一列本因加速防撞的D3115，巧合的停车，另一列本因迅速减速刹车的D301反而巧合的加速奔向地狱之门…… 这荒唐的巧合，促使了这场悲剧的诞生。。。