故事的开篇是一个模拟二号地球的游戏，之后更高层次的表现都是通过这个游戏来体现的，这个玩具可以比在电视游戏中更加真实地创造出一个完全的小地球

主角先是拿起一个金属作为模拟地球二号的铁和烙合金然后再让地球自转起来往铁上面喷水和二氧化碳在小型地球的表面，然后再加入小石头作为这个地球的小行星（结局里面主角所处的星球也是更高层次文明的一个模拟地球玩具，这个篇章中的星球也是更高层次文明的玩具所以理论上主角对模拟地球二号的一切行为都可以作为更高层次创造这个地球的具体体现）

然后再把现实世界中的手电筒作为模拟地球二号的太阳加入小石头作为模拟地球二号的微行星，微小的小行星被模拟地球二号吸引一块的冲向

微型小行星坠落时产生的高温模拟地球二号的表面融化形成了岩浆，地球诞生之时曾遭受过无数小行星的撞击，然后他们上升成为了大气层主角刚刚喷上的水则成为了氧气

模拟地球二号变得圆滑起来，天空开始下雨雨水漫过了大地形成了海洋

海洋最先开始诞生出的生命，最新出现的海藻制造出了大量的氧气，海洋生物不断走出陆地形成了各种各样的陆地生物

最开始的生命形成了地球变成了蓝色和绿色的星球，因为主角感觉有点热所以开启了空调，由于过长时间没关所以模拟地球二号表面冻结大部分生物都冻死这就是地球上的冰河世纪，变成一片黑色

在冰河世纪过了以后恐龙才开始诞生，由于可以随意地制造模拟地球二号内部的环境让它不断地诞生出生命所以才被称为可以成为新地球的神

在模拟地球二号内部也可以随手制造大地震导致盘古大陆的分裂

随手丢下来的普通石头也会变成恐龙灭绝的与巨大的陨石

最终结果是模拟地球二号已经发展出了和主角所处的时代一样的现代文明和类似于现实世界中模拟二号那样的玩具

故事最后主角自己和他所在的星球不过是更高等级人类的一个模拟地球玩具而已，所以主角对模拟地球二号的一切行为更高等级的文明对地球都可以做到

天外有天神外有神，主角永远不会知道他也只是另一个玩具中的一个角色而已，故事的结尾也是留白了现实世界中的到底是人还是更高等级的一个玩具

现实世界中主角对模拟地球二号的表现把它放在一个架子上让它能够自转形成地球的自转然后喷水和二氧化碳形成星球表面的大气层加入小行星把星球表面变成熔岩形成陆地，用小型的手电筒来制造出太阳，所以主角所在的地球的太阳也不过是更高等级文明的手电筒，随手丢下的一块小石子都会形成灭绝生命的小行星，空调的冷气会形成冰河世纪覆盖三分之一的大陆，随手的一下可以导致盘古大陆的分裂，可以做到制造出太阳冰河世纪恐龙灭绝的陨石，形成大气层，制造出微型小行星之类的举动