三 相遇
大约2148纪，列车抵达匹诺康尼，发现这里和公司描述的不太一样。他们第一个遇上苏萨汽水先生，苏乐达的发明者。然后又遇上了哈努努哈努兄弟，不过这最初的相遇并不愉快，哈努努估计是把列车团当成公司走狗了，直接来了发火箭炮。不过考虑到列车出发的原因这还真没错。在苏萨先生的调停和真·公司走狗鳄鱼的助攻下，双方冰释前嫌，达成合作。
钟表小子
滴答，原来鳄鱼商人在骗我们，这里根本不是什么暴动，而是镇民们忍无可忍的反抗！
接下来出场了一连串新人物，简单介绍下：
三 其他人物
三 解放
战争过于惨烈了，有的囚犯投奔公司，有的自立山头。在决战中，由于叛徒的出卖，起义军的假面愚者和悲悼伶人都牺牲了，他们化作了欢欣和悲伤的齿轮，米哈伊尔也产生了愤怒的齿轮。最后，他平静了下来，化作最后一个齿轮。
友好讨论，文明...
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决战的前夜，哈努努做了个怪梦：他看到了一颗大树茁壮成长，一片荒原建起高楼，一枚钟表埋在地下......最后是一首平静的事。
战火平息。付出了很多牺牲后，噩梦小镇变作了美梦小镇。
事后，米哈伊尔想了很多，决定同拉扎莉娜和铁尔南一起留下来建设匹诺康尼，格兰霍姆理解他们的想法，还把阿蒙森先生的帽子留给了他最后的学生——米哈伊尔。两方人马就此分离，米哈伊尔估计没想到，这一别就将是诀别。
此时是2148纪，列车的下一站二相乐园正处于烬土纪元，他们将同当地人一起抵御界外天魔主——归寂的入侵，最终全军覆没......
[领航员] 格兰霍姆：拉格沃克，你要去哪里？我们该出发去下一站了。
拉格沃克·夏尔·米哈伊尔：......
[领航员] 格兰霍姆：哦，这里让你想起自己的家了？
拉格沃克·夏尔·米哈伊尔：不，可能走不了，我准备留在阿斯德纳，和拉扎莉娜跟铁尔南一起。
[领航员] 格兰霍姆：没关系，我早就知道你们几个是留不住的，安心去吧，朋友，把这个也带上。
拉格沃克·夏尔·米哈伊尔：这是……阿蒙森先生的帽子？为什么……
[领航员] 格兰霍姆：他临走的时候，说要把它留给他最好的学生。我想，现在是时候了。
拉格沃克·夏尔·米哈伊尔：放心，不是所有旅途都要通向星海。就算离开了列车，我们的[开拓]也不会结束。
[领航员] 格兰霍姆：再见了，拉格沃克。照顾好铁尔南和拉扎莉娜。记得……要给我们写信啊。