看到一个介绍炼金术历史的提到，炼金术和化学的区别在于，炼金术是非客观的，存在一个假定的价值取向和终极目标的。
炼金术的终极目标是贤者之石完美物质，制造完美的物质也是提升自身的过程，物质向贤者之石转化的过程是高尚的，反之是堕落的。并且贤者之石才是重点，过程中的化学反应是不重要的。
与之区分的“庸俗”炼金术，注重更实际的目标，认为物质往哪个方向变化都是可以的，关注反应过程中的知识。这类实用炼金术后来变成了化学。
牛顿研究炼金术，但是他同时关注炼金术过程中的知识和终极目标贤者之石，就好像认为贤者之石会是他破解自然秘密的通关证明。
这种观念就像是神秘主义到科学精神中间的分界地带，认为终极的神存在，并且自己可以凭借自身的才能到他的身边领取一个终极的通关奖励。