抑郁症往往有家族史,若父母一方患有抑郁症，孩子患该病的机会将增加10%-13%；在一卵双胎的孪生子中，这个数值更大。如果孪生子之一人患抑郁症，那么另一个孪子一生中患抑郁症的机遇是70%。然而，也有例外, 即有抑郁症家族史不一定发病，反之，有些患抑郁症的人根本无家族史。目前发现的遗传基因异常有:
　　1、美国、英国和新西兰等科学家在《科学》杂志介绍说，发现“5-HTT”基因（血清基转运基因）负责调节人体中的血清基水平(血清基负责大脑神经细胞间的信号传递)。每个人都携带有分别来自于父体和母体的两个“5-HTT”基因副本。且副本有长、短之分，在不同人体内分别以3种方式组合：即① 2个长副本；② 2个短副本；③ 长短各一。而且研究发现，体内携带至少一个“5-HTT”基因短副本的人更容易变得抑郁，而携带两个基因长副本的人则较容易摆脱精神抑郁。携带至少一个“5-HTT ”基因短副本的人33%患上抑郁症，携带2个基因短副本的人发病率高达43%，而携带2个长基因副本的人则仅有17%患病。
　　2、2005年1月出版的Neuron刊登张晓东最新研究成果认为，可能是hTPH2基因直接影响了5-HT的合成，从而引起抑郁。
　　3、匹兹堡大学医学中心的研究人员于《美国医学遗传学杂志》上发表的研究成果强有力的证据证明具有单极性情绪紊乱的妇女的抑郁症的病因与染色体2q33-35特定区域异常有关。
　　4、女性激素调节：基因遗传因素提高了女性患抑郁症几率的50%。科学家们发现了很多和抑郁症有关的、只有在女性中才会出现的各种基因突变，包括一个与女性激素调节密切相关的基因。