明德书院隶属于北京大学附属中学元培学院，“明德”二字出自儒家经典《礼记·大学》开篇句：“大学之道，在明明德。” 2010年，作为理科竞赛单元，五单元成立。2012年，在北大附中单元制改为书院制的情况下，五单元更名为“元培书院”。元培书院的同学主动参加各科竞赛，取得了优异的成绩，众多优秀的学生形成了以“追求卓越”为核心的“元培精神”。2014年，“元培书院”正式更名为“明德书院”，延续了“元培精神”，又加入了擅长其他领域的杰出学生，形成了一个更多元的书院。2017-2019年，各个书院平行分配后，明德书院继承之前的招生惯例，并在保留竞赛的传统上大力吸纳拥有各种不同兴趣的同学，明德书院逐渐成为各个不同方向优秀人才的汇集之所。本着“追求卓越”和“对知识的尊重”的书院文化，明德书院希望发现更多有自己的理想、并为其积极努力的同学。2022年，明德书院回归元培体系。在诸多变化中，明德书院焕发出全新光彩。
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