神是这部剧的敌对目标，指向同一的敌人。但是没有一个具体的神，只有不同的对象指涉

对于EVA的定义，倒不必纠结EVA的外形，我看到的一个很好的定义：既非天使亦非人类，非亚当亦非莉莉丝，EVA 是诞生自神明却模仿人类形态（或非人类形态）的人造存在，内部经过改造，被装甲束缚、受科技操控。
因此幻想EVA理论上应该不属于EVA，首先它并非人造，其次它甚至不存在于正常宇宙中，且没有确定的形象。它是某种既存在又不存在的事物。

旧剧场版和tv是否也是上一轮文明的下一轮轮回,有可能，但我们并不知道哪里是起点。显然并不是所有人都有上一轮回的记忆，从渚薰的台词——比如"又是第三次吗…？"和"这次一定要让你幸福"——强烈暗示他记得过往事件。
所谓的"死海古卷"可能是前几个循环周期中人类记录并保存的文献，记载了《新世纪福音战士》所描绘的事件。碇源堂和 SEELE 本质上掌握着事件发展的完整记录，并在每个周期利用这些信息来微调他们实现目标的计划。直到真嗣在《新·福音战士剧场版》中最终打破循环，这一切才得以终结。此前，他只是重建了人类文明，却让世界维持原状。而在新剧场版中，他最终将 EVA 彻底从存在中抹除。

真希波像是一个机械降神，其身份在另一个帖子里有所探讨：https://tieba.baidu.com/p/10185192227。
至于那些与TV与EoE不一样的细节，可以理解为每一个轮回下变动的结果，因为每一个轮回都与上一个轮回有所不同，直到最终达到《终》的结局，这解释了nerv的基层组织发动起义，脱离nerv有组织性的阻止人类补完计划。加持没有像过去那样成为一个弃子而消失，而是成为了人类的抵抗者，先驱，带领所有人摆脱了核化的命运。赤木也向碇源堂开出了过去本该开出的那一枪等变化。这些变化不一定是这一轮回中独有的，因为我们并没有看到以前的轮回的样子，毕竟距离EoE已经过去了28年之久。