芦山峁遗址4个样本：均来自M1墓葬，包括墓主及3名殉人（编号LSM_1、2、3、4）。 石峁遗址3个样本：1件与青铜、玉环共出的桡骨（SM_1），2件嵌入石墙的牙齿（SM_2、3）。 陶寺遗址1个样本：来自陶寺中期大墓ⅡM22（编号TS），该墓随葬品达72件，是陶寺文化已知最大墓葬。
核心研究成果：
1. 单倍群遗传特征 8个个体的遗传标记分析显示：Y染色体单倍群以汉族中常见的Oα、Oβ为主，同时包含东北亚与汉藏人群中低频出现的N1a、N1b2单倍群；线粒体单倍群多样性显著高于Y染色体单倍群，但整体范围与此前报道的陕北、晋南新石器时代人群多样性基本一致。
2. 群体遗传组成与血统来源 群体遗传学分析揭示三大关键信息： 一是新石器时代晚期晋陕地区多数个体遗传组成相似，且遗传位置与地理分布高度关联，核心遗传背景为“黄河流域相关血统为主、古代东北亚相关血统为辅”，与既往研究结论一致。3. 特殊个体的突破性发现 芦山峁遗址的LSM_1个体呈现两大意外特征： 一是遗传背景特殊。携带红山文化相关（WLR_MN）的遗传背景，与区域内主流遗传特征差异显著。
二是近亲繁殖痕迹。对其ROH的分析显示，LSM_1可能为一级表亲的后代。结合红山文化相关人群中也检测到大量ROH的现象，研究者因此推测：红山文化或存在“近亲繁殖”的现象，对神权权力的过度强调可能使“维持血统纯度”被神圣化，进而推动近亲结婚实践。