对于封闭已久的21世纪人类来说，科学已经是在跳跃式发展了，因为外来的各种力量的介入，已经来不及连续式地进步，往往一个现象和模型被发现和建立，回头一看，和其他理论脱节很远，中间还有许多的断层需要时间去弥补，总研究部庞大的“研究机器”疯狂地运转，很多研究员的一天的休息时间，已经被压缩到6个小时以内。

1.金陵城的暗能型核电站：
.
现在煤炭早就用完了，金陵城附近也不产煤，做不到火力发电，所以总研究部冒死从浙省（浙江省）分拆了核电站的机组，运回金陵，配合黑暗能量的最新研究，在地下组建了超小型的暗能型核电站，算是四维暗能量的基本科技，就是不太稳定，经常会停电，所以除了一些必要的道路和地方，其他地方全都被强制限电，现在整个金陵城就如同一个微光城市，而这个城市的命脉不但是外面防线上的军队和粮食，还有可以给人类带来光明和动力的电能。

2.孙教授：
.
（永镇之族、第六纪地球人、异源后裔人类、五族基源觉醒人、寒武前人后裔、含有多能族天导人的基源程式片段）
.
同时是总研究部的研究员又是黑武总部的黑武的人，那是一只巴掌就能数得过来的，而且还都是老家伙，孙教授就拥有黑暗武士（可能还是一级丙等都不到）和特级总研的双重身份，在总研究部是举足轻重的人物，几大新式武器的开发，他都是关键人物。（可能就是金陵城的第一道防线外，那种带有丝丝火元气能量的防御塔重机枪、以及威力远胜以前武器的那种可以迅速消灭金甲虫的强力炮弹。）
.
总指挥待孙教授如敬上宾，除非特大的事情，否则这位热衷于暗能量科学研究的孙教授几乎不出总研究部的大门半步，而楚云升来到金陵城后，孙教授立刻特制了一枚总研究部的徽章给楚云升，试图拉拢他倒向总研究部。
.
黑暗刚落人间，楚云升自己编制的怪物手册，满满地记载着他所遇到的一切大小怪物的资料，他让景恬帮自己抄录一份，送给了总研究部的孙教授，孙教授看到这份资料，下巴都不能自然合拢，其中一些怪物，作为金陵城总研究部的信息汇总资料处，都没有它们详细的生物特性描述，只是从一些逃亡者管中窥豹的报告中提取资料，有时候甚至自相矛盾，像楚云升这份详尽充实的资料，对于科学家来说，评为无价之宝，也毫不过分，天轨重叠后，到底有多少怪物涌入地球，谁也不知道。

3.方教授的暗能Ⅰ型步枪：
.
在阳光时代，高斯电磁能的闭合磁场无法缩小到一把步枪的程度，但是黑暗时代的暗能量场可以做到，物理专家方子文教授根据楚云升在迷雾之城建立的暗能量场图形和方程式，建立Ⅰ型暗能量场，在步枪内部建立了闭合的场势，特制子弹在Ⅰ型暗能量场中瞬间得到加速，高速运动，并夹带火属
性暗能量，破坏力十分巨大，可以射穿一般赤甲虫的暗能量罩及甲壳。

在平均十发子弹全部击中的前提下，可击毙一只赤甲虫，打个比方，算作一颗子弹的威力是1克TNT的话，夹带的火属性暗能量，达到相当于上百克TNT的威力，需要充能的步枪本体的暗能量场瞬间加速，再增加相当于上百克TNT的威力的话，一颗子弹的威力就可以达到两三百克TNT，十颗子弹的威力，就可以达到两三千克TNT。

和用枪的黑暗武士配合起来，威力更为巨大，在这个火虫横行的时代，一丝一毫能够增强实力的东西，都被视为最为珍贵的存在，不知道多少用枪的火能黑武，对暗能Ⅰ型步枪梦寐以求，如今方教授被总指挥部私下誉为“暗能1型步枪之父”，正红得发紫。

暗能Ⅰ型步枪和特制子弹的制造工艺十分复杂，原材料也极为匮乏，目前也只能在实验室制造，数量极为稀少，代价极其昂贵，但可以让一个普通人类立刻拥有相当于一级甲等的黑武攻击能力，一柄让普通人能够像黑暗武士一样战斗的武器，是所有普通人类的渴望，但除了军武以及总研究部的内卫部队有少量的配备，流传到外面的几乎少得可怜，能弄到的，无一不是有着雄厚的背景势力。

能量是守恒的，暗能Ⅰ型步枪的缺陷是不能像普通枪支那样无限地使用下去，枪的本体每过一段时间就需要进行充能，使用的子弹也必须是富含暗能量的物质，否则根本没有效果，所以总研究部正在计划制造一种机器，从赤甲虫的尸体分离出制造暗能Ⅰ型步枪和子弹的关键物质，一旦研制成功，可以想象，到时候谁手上的虫子怪物尸体多，谁就能换取更多的新式武器，甚至是粮食。

总研究部的防御盔甲熔铸研究也到了最后阶段，赤甲虫和青甲虫的甲壳就是其原材料，总指挥部已经密令军方开始收集以往打死的火虫尸体，在迷雾之城，那个城管万物荣那些人，就开始利用甲壳作为盾牌，总研究部能想到利用甲壳制造防具并不奇怪，威力巨大的暗能Ⅰ型步枪、全自动并且无声的暗能Ⅱ型步枪、熔铸虫甲技术等等，都是四维暗能量的基本科技。

4.霍教授研究范围的新食物试验：
.
为了解决越来越严峻的食物危机，总研究部制造了新食物改造机器，将城外古怪的虫子、生物收集回来，经过分析处理加工，然后寻找人类自愿者，尝试食用这些被加工处理过的食物，再通过自愿者食用后的反应数据，并解剖试验失败后死亡者的尸体，一步步完善新食物处理工序和办法，最终目的是将怪物和生物处理为人类可以使用的新食物来源。
.
这种实验，当场死亡率高达50%以上，而侥幸活下来，健康也受到极大的损害，如此恐怖的死亡率，却依然有人愿意前来自愿实验，这些人的想法自然绝不是《自愿书》上写的是为了人类未来的希望，而是为了食物和药品，凡是自愿实验的志愿者，都将获得一定数量的食物和药品，为此，许多人，如飞蛾扑火地“自愿”参加这个实验。
.
无毒的赤甲虫肉是新食物试验的主要对象，但是已经失败很多次了，在这个文明被彻底摧毁的时代，食物成了限制肉体生存的最大障碍，甚至有过于火虫的直接残杀，金陵城到处都是衣衫肮脏的饥民，已经食物短缺到有穷凶极恶的人，忍受不了饥饿，常常在最黑暗的时候，偷走露宿街边的饥民的幼儿的地步。
.
因此，总指挥当初根本就不同意总研究部的《地球物种保存计划》，金陵城每天都在饿死人，根本就没有多余的粮食浪费在那些诸如老虎之类的动物身上，但总研究部的科学家不干，后来矛盾越闹越大，连总指挥部自己内部都出现了分歧，结果没多久，这个计划竟然通过了，据说和总研究部的新式武器有关。
.
除了“虫子”和“非人类”这两种危机，金陵城越来越严峻的食物危机，已经是三大危机之首，到了接近崩溃的地步，一旦食物危机能够缓解的话，整个金陵城在对抗火虫的战略上，就会显得从容不迫，大大扩展了科学研究在时间上的纵深能力，但楚云升没有大量驱毒的办法，只能总结一些驱毒符对驱除毒素的宏观上的正确描述，去激发孙教授他们的灵感和思路，进行微观上的操作和研究。
.
霍教授第一个将楚云升的资料稿纸抄入手中，这完全是因为在迷雾之城，楚云升神来一笔，建立了不可思议的图形，最终直接导致了暗能Ⅰ型步枪的研制成功所致，楚云升的驱毒资料也一样匪夷所思，不过随着暗能量和暗物质对传统物理学和生物学的大量冲击，他们已经打破了固步自封、企图用原来的科学体系去证明现在的科学现象合不合理的惯性思维，金陵城研究部，已经观察到这个世界的所有科学规则体系全部都发生了变化。

5.高级研究员的机密大楼：
.
总研究部里，戒备最森严的白色实验楼，重兵围围，初级研究员的徽章在这里也不管用，只有高级研究员才有特权自由进入这栋大楼，比如赵菱和孙教授的周助理，但他们也无法带其他人入内，只有孙教授那种总研级别的人才能接人进去；孙教授领着楚云升走进一间四周都用青甲虫甲壳加固过的实验室，里面放着同样用青甲虫甲壳制作的三个笼子，笼子里面是三只活的赤甲虫，腿部和钳子被打碎，口腔用青甲虫的腿部堵住，大概是防止它喷射腐蚀黏液。
.
根据孙教授他们长时间的研究，赤甲虫作为虫子中最为低等的生物，至少有三种以上的方式相互联系，传递信息；第一种，嘶鸣的方式，孙教授他们大量录制了它们嘶鸣的声音，加以分析，它们嘶鸣的频率和音量，和它们采取的行动有着明显的联系；第二种，是气息，它们能感觉得到多种气味以及黑暗武士的暗能量波动，以发现目标。
.
第三种，目前只是猜测，根据历次虫子的进攻行为表明，它们似乎受到同一的指挥，这种控制，孙教授他们目前还没有办法检测到，但根据生物学家的推测，这种方式必定是存在的，而且是它们的主要控制方式，而那种紫炎魔虫，对赤甲虫、青甲虫以及金甲虫，似乎存在一种领导和被领导之间的关系。
.
孙教授按下一个机器按钮，发出嘶鸣声，笼子里的赤甲虫，立刻警觉地挣扎，四处张望，这是虫子发出警报的嘶鸣声，总研究部曾在黑武的战场上使用过，但效果并不是特别好，只能起到局部的稍稍混淆作用，所以孙教授猜测它们应该还有其他联系方式。
.
孙教授他们已经继续派人收集各种赤甲虫的嘶鸣声音资料，这是目前总研究部重点研究方向之一，已经立项，称之为音频干扰武器，另外总研究部使用过各种化学毒气对虫子进行活体实验，效果并不明显，所以暂时放弃了这个方向的研究。
.
总研究部送一台特制的音波采集机器到西区防线，万一以后紫炎魔虫再次出现，希望楚云升能在战斗的时候，顺带迫使它发出各种不同的嘶鸣声波，让孙教授他们可以采集到充足的声波标本，但楚云升只能尽力而为，因为紫炎魔虫实在过于厉害，一旦发现，只能尽快将其杀死，除非楚云升到达二元天的巅峰境界，或可一试。

6.绝密三楼和特级总研会议室：
.
实验楼的三楼，是实验楼里最绝密的场所，门口都有全副武装的黑暗武士驻防，在火虫撤退后，军方派人渡江取回楚云升炸毁的巨坟残余，以及拍下巨坟被炸开后的内部照片，巨坟的内部分布结构模式，十分奇特，孙教授他们按照仅剩下的尚未炸毁的一部分建立模型，得出了一些惊人的推测，如果完全破解巨坟内部的秘密，人类的科技能力将出现划时代的飞跃。
.
这些巨坟通过内部的结构，构成奇特的暗能量场，造成空间扭曲，拦截人类的空中武器，但内部是如何抑制炸弹爆炸的原理，总研究部还不得而知，不过巨坟带来的信息很强烈，通过对它的研究，孙教授他们已经取得好几个突破性的进展，新型的暗能Ⅱ型步枪，因此即将要研制成功，人类的整个科学体系已经被打破，就目前掌握和发现的理论，完全颠覆了人类以前对整个宏观和微观世界的认识。
.
孙教授带楚云升来到三楼的会议室，里面的长形会议桌两旁正坐着十来个人，大多都是上了年纪的人，只有一男一女两个年轻人，显得特别的突兀，男的楚云升不认识，女的是给楚云升带来第一幅地图的那个赵菱小姐，只是现在一身光鲜的外表，和当时在恐怖之城与迷雾之城的落魄惨景完全不一样。
.
这群科学家早就根据各自的立场，分别坐在长形会议桌的两面，当然如果那两个年轻人也算的话，虽然楚云升觉得他俩个很不靠谱，估计是谁的学生，或者关系户来着，比如孙教授就是赵菱的老师，而那个最年轻的姓肖的男人，则坐在一个50多岁的女科学家彭教授的旁边。
.
这些都是总研究部的各个领域的专家，里面包括楚云升最早认识的孙教授、研究出暗能步枪的方教授、以及在迷雾之城里解剖觉醒战士的尸体给楚云升进行分析了解的生物医学专家霍教授，可能会议室里的十几个人，全都是总研究部的特级总研，也都是老教授，当然不包括赵菱和另外那个年轻男人，他们只是高级研究员。
.
总研究部一直对虫族的行为社会性以及其目的争论不止，争论的焦点，就是虫子内部是不是存在一股神秘、甚至超越人类智慧存在的东西，所以才有着统一的指挥和行动，表现出高度协调性；还是如同地球上的普通昆虫一样，不过是一种放大并具备暗能量运用的昆虫，在本质上，那种深入基因就具备的习性，不存在过于神秘的领域。
.
这对金陵城以后和虫子继续作战的路线，将有着重大的影响，一旦对虫子的社会形态了解出错，整个战略上，都将出现很大的变化，等发现错误的时候，再去修改，就已经迟了，直到楚云升渡江炸坟回来，告诉他们一个事实，虫子在它的某种精神力量的驱使下，本能地试图攻入金陵城中央区，它叫“珉”。

（3）黑暗武士管理总部
.
根据总指挥部和总研究部的最新文件，现在金陵城的所有觉醒人类都统称为黑暗武士，受到黑暗武士总部的测评和管理，黑武管理总部是觉醒人类的自发性组织，后来被总指挥部强行官方化，现在世道乱了，警察已经不管用了，那些黑暗武士常常连枪都不怕，能镇得住黑武的，除了部队，就只有各占地盘的黑武他们自己。

军方部队要集中到外围的防线，根本没有多余的兵力照顾城区的每个角落，只防护着重点单位的重点地区，总指挥部也就默许了他们的存在，给黑武帮派起了官方名称，叫黑武安防，各占一带的地盘负责，靠地盘安防获取食物来源。

黑武总部测评后，会颁发正式的徽章以及信息卡，黑武的徽章胸牌上面刻画着地球的形状，下面用汉字写着“黑武”和“评定等级”，这个东西在城区里面挂着，可以省去很多麻烦事，起码在金陵城，具备刑事豁免权，从一个主力师的黑武独立团就有300多人来看，十个主力师加起来，整个金陵城可能有3000多个黑武，三级以上的黑武可能有一百多个。