其实早在《破》的时候，式波明日香就已经和元明日香，即“式波原型”融合过一次了（有庵野亲笔绘画为证，不得不说，庵野画人物的能力是真的不行），后来因为某些变故，元明日香又和式波分离了。但元明日香的使徒之力却留在了式波明日香的体内。现有证据显示，元明日香极有可能就是旧剧场版的惣流明日香或者惣流明日香转世，我个人认为，这也解释了为什么式波明日香的使徒封印打在左眼上。因为惣流明日香在旧剧场版和量产机搏斗时，左眼受过伤，所以左眼的使徒之力就比较弱，容易封印。

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eva《终》的新特典显示，新剧场版剧中的那些无头eva原本是有头的，而且头的形状就是初号机。这说明最后真正引发真三冲的就是初号机。

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根据现有的资料汇总，我们可以推测一下《破》与《Q》之间究竟发生了什么：
初号机被卡西乌斯枪封印后，第三新东京市被废弃，nerv全体成员被关押，接受联合国审查，只有碇源堂和冬月耕造逃跑，与seele会合，渚薰开始担任nerv总司令的职务。不久，nerv全体成员全部无罪释放，但自此以后，nerv全体成员和seele反目成仇，渚薰也因此回到了seele，但他内心仍然向着nerv一边，并和加持良治保持着联系。
seele派出渚薰驾驶六号机前往中央教条区和莉莉丝引发真三冲，渚薰第一时间把这个情报告诉了加持良治，加持知道事态紧急，就亲自带着一把朗基努斯枪和从初号机身上拔下来的卡西乌斯枪，乘飞机前往中央教条区，强行进入六号机，与渚薰合力将朗基努斯枪插到了莉莉丝身上，并砍掉了其头颅，然而六号机自己也被莉莉丝感染，无奈之下，六号机只好用卡西乌斯枪自插。此时莉莉丝的身体仍在膨胀，危急关头，nerv唤醒了明日香，在她的左眼打上了使徒封印，让其驾驶二号机将另一把朗基努斯枪插到了莉莉丝身上，这才阻止了膨胀的继续。
与此同时，seele发现碇源堂想和他们争夺补完的主导权，于是便派出八号机前去摧毁初号机。此时，nerv手中的底牌只剩下了勉强还能战斗的二号机和打着使徒封印的明日香。在苦战一番以后，二号机终于将八号机的插入栓拔出，二号机自身的电能此时也已耗尽，然而令人没想到的是，八号机竟然配有傀儡插入栓，还能继续战斗。此时赤木律子又说明日香体内的使徒并没有死，只是暂时被封印，明日香随即摘掉眼罩解除了使徒封印，利用使徒之力终于将八号机击败。
然而，随着使徒污染的扩散，明日香准备拉下二号机的自爆电闸，但令人没想到的是，此时的她触发了真嗣的心灵感应，初号机顿时再次觉醒暴走，并且幻化成了真嗣的模样，开始像《破》里救绫波丽那样救明日香，此时初号机体内的真嗣仍然处于休眠状态。初号机成功将明日香体内的使徒之力压了回去，但强大的力量使得元明日香，即“式波原型”与式波明日香分离，使徒之力则留在了式波明日香体内。同时，初号机的再次觉醒终于引发了真三冲，此时，四个亚当出现，与初号机战斗，斩断了初号机的四肢，但同时四个亚当也被初号机用长枪刺穿。此后，nerv与seele暂时休战，并将初号机送上了太空，nerv也改名为wille，开始到处搜救真三冲的幸存者。
与此同时，真希波•玛丽正在密会冬月耕造，为wille接下来的战斗做好了准备。

我越发觉得庵野应该不懂eva， 要不和k社商量下，下一部咱们e吧推举先发先生您来当导演，

这么晚还不休呢，感谢楼主耐心科普，确实《终》出来得太晚太晚，没按照序、破的节奏来。
很多观众在这么这么长的时间跨度里，人生轨迹都出了变化，怎么可能还指望以同一心态再去观赏呢。

而且现在都是流媒体冲击，刚日本一上映，很多片段和“分析”就在各种地方可以刷到
现在电影都可能不再是主流手段了，很多新一代人群刷短视频太多的，根本就没那个耐心在电影院一坐几小时去看，真是可惜花那么多时间花那么大功夫，做出来的还不尽人意。

最终后一部终，看懂了东治把衣服给真嗣穿（致敬Q真嗣套了东治的衣服），班长把衣服给绫波丽穿。但剑介把衣服给明日香穿当我是没看懂的，也许剑介特别呵护爱护明日香？

看了第一段就不想看了，哪个官方哪个解析验证的父女情感？除了宫村一开始没看懂还有哪个和官方搭边的人提过吗？俩人同龄也能有父女之情吗？有点意思。roe式波复制人根本就不缺父爱，元明日香父母至少双全，不同于惣流连和加持的戏份都删了。

衣服就是Wille的，但是不妨碍剑香锁死，毕竟十四年的陪伴在。