1. 原核细胞“同一时间空间转录和翻译”的机制名称
这一机制被称为 "转录-翻译耦合"(Transcription-Translation Coupling)。
这是原核生物(细菌)的典型特征,因其无细胞核,转录(DNA→RNA)和翻译(RNA→蛋白质)可在细胞质中同时同地进行。
2. 原核细胞中RNA聚合酶与核糖体如何合作?
其协作依赖于 物理位置的紧密接近 和 RNA链的实时传递,具体过程如下:
关键步骤:
RNA聚合酶先行
RNA聚合酶结合DNA启动子,开始转录生成mRNA链(5'→3'方向延伸)。
核糖体快速结合
mRNA的5'端刚被转录出来(甚至尚未完成转录),核糖体就立即结合到mRNA的起始密码子(AUG)上,启动翻译。
核糖体“追赶”聚合酶
核糖体沿新生mRNA移动合成蛋白质,紧随RNA聚合酶后方(距离约10-20nm)。
多个核糖体可依次结合同一mRNA,形成 "多聚核糖体"(Polyribosome)。
动态互作维持效率
空间屏障作用:核糖体覆盖mRNA,防止其折叠成复杂二级结构(否则会阻碍翻译)。
抗终止作用:核糖体的推进可阻止ρ因子(Rho factor)介导的转录提前终止(详见下文)。
协同速度调控:翻译速率可影响RNA聚合酶的暂停或释放(通过蛋白因子如NusG)。
为何需要耦合?
高效性:避免等待mRNA完全合成,快速响应环境变化。
保护RNA:核糖体覆盖mRNA,减少核酸酶降解。
调控基因表达:翻译状态可反馈影响转录终止(如衰减作用,Attenuation)。
3. 古核细胞(古菌)是否采用相同机制?
不完全相同! 古菌的机制介于细菌和真核生物之间,更偏向真核特征:
关键差异:
1. 转录-翻译耦合机制
细菌 原核原核: ✅ 强耦合 - 转录和翻译在细胞质中同时、同空间进行,效率高。
古菌: ⚠️ 部分耦合 - 转录也在细胞质,但耦合程度显著低于细菌(翻译起始较慢,机制更接近真核)。
真核生物: ❌ 完全解耦 - 转录在细胞核内进行,翻译在细胞质中进行,两者在时间和空间上分离。
2. RNA聚合酶
细菌 原核原核: 简单 - 通常由 4-5个亚基 组成。
古菌: 复杂 - 由 12个或更多亚基 组成,结构类似真核生物的RNA聚合酶II。
真核生物: 复杂 - 由 12个或更多亚基 组成(分为Pol I, II, III)。
3. 翻译起始因子
细菌 原核原核: 使用细菌特有的起始因子,如 IF1, IF2, IF3。
古菌: 使用类似真核生物的起始因子,如 eIF1, eIF1A, eIF2, eIF5B 等。
真核生物: 使用真核起始因子(eIF系列)。
4. 转录终止机制
细菌 原核原核: 主要依赖 ρ因子 Rho−dependent 或 固有终止子 Rho−independent,依赖发夹结构。
古菌: 类似真核生物 - 通常需要终止因子(如 aCPSF1)识别特定的终止信号(常包含 polyUU序列)。
真核生物: 依赖 polyAA信号(指导mRNA加尾)和终止因子。
5. 核糖体结合位点 mRNA上
细菌 原核原核: 主要依赖 SD序列 Shine−Dalgarnosequence - 位于起始密码子上游,与16S rRNA互补。
古菌: 混合模式 - 部分古菌mRNA有SD序列,部分则采用类似真核的5'端帽子结构 5′cap5′cap 依赖的机制。
真核生物: 主要依赖 5'端帽子结构 Cap−dependent- 核糖体通过帽子结合蛋白复合物识别mRNA的5'端帽子
古菌的具体特点:
转录在细胞质,但耦合较弱
古菌无细胞核,转录翻译均在细胞质,但转录机制更接近真核(如需要TATA框、TFB/TBP转录因子)。
翻译起始依赖真核样因子(如eIF2),速度较慢,导致耦合效率低于细菌。
核糖体可能“跟随”聚合酶
某些古菌(如硫化叶菌)中存在类似细菌的耦合现象,但普遍性存疑。高温环境可能促进耦合(加速分子运动)。
终止机制不同
古菌转录终止依赖终止因子(如aCPSF1) 和 polyUU序列(类似真核),而细菌依赖ρ因子或发夹结构。核糖体无法像细菌一样抑制终止。
总结
原核机制:细菌通过 "转录-翻译耦合" 实现高效基因表达,核糖体与RNA聚合酶动态协作。
古菌机制:转录装置接近真核,翻译起始较慢,耦合程度显著低于细菌,且依赖真核样调控因子。
进化意义:古菌与真核生物的相似性支持 "古菌起源假说"(真核细胞由古菌宿主演化而来)