在《魔法少女的魔法审判》中，地下室保险柜的密码为169231（这串密码没用，应该不算剧透吧），这一串密码并不是随机的，它指向历史上一场同样是为了找出“魔女”并处刑的案件（也可以视为本游戏的原型）——塞勒姆魔女审判案。
这串数字里藏着关键时间，1692年是案件爆发年份，3月1日是首次审问的时间。此案短短一年，19人被绞死、1人被巨石压死、至少5人死于狱中，150余人因“女巫嫌疑”被捕，一切始于几个女孩的怪异举动。
1692年1月，塞勒姆牧师的女儿伊丽莎白（9岁）和侄女阿比盖尔（11岁）突然抽搐、口吐白沫、胡言乱语，医生查不出病因，便判定“被巫术所害”。随后其他女孩也出现类似症状，2月她们指认了3个“施巫者”：黑人奴隶蒂图芭（因讲“神秘传说”）、贫穷寡妇萨拉·古德（常与邻居争吵）、独居老人萨拉·奥斯本（不参加宗教活动、再婚不合规），这3人成了第一批替罪羊，也点燃了小镇的恐慌。
这场审判是彻头彻尾的“有罪推定”，所谓“取证”全是荒诞判定。核心有三类“铁证”：一是“幽灵证据”，指认者（多为最初的女孩们）称“看到嫌疑人灵魂/幽灵作案”，哪怕无人佐证，法官也认定有效；二是“间接证据”，家里有草药、木偶，养小动物，和邻居有矛盾，甚至“审判时冷静”“拒绝认罪”，都能被当作“施巫证据”；三是酷刑逼供，“水试法”将人绑住扔河里，浮起就是“女巫”，沉下可能清白却常溺水，还有“精神酷刑”日夜折磨，不少人撑不住“认罪”甚至编造他人“施巫”。
随着被捕者增多，“指认他人”成了“生存法则”，法官会告知嫌疑人“指认其他女巫可暂免死”。于是恐慌失控，邻居因土地纠纷指认对方，仆人因被责骂举报主人，甚至家人为自保互相攀咬。最初指认的女孩们还扩大范围，连殖民地高官、牧师妻子都被指控，原本针对“边缘人”的审判，变成无差别的迫害。
1692年6月到9月是处决高峰期，处刑地多在绞刑山。19人被处以绞刑，执行时嫌疑人会被押往绞刑山，沿途遭居民辱骂扔石头，法官最后劝降无果便行刑，多数人至死喊冤，死后尸体被扔浅坑，家人不敢认领。71岁的农场主吉尔斯·科里是唯一死于“压刑”的人，他为替被指控的妻子辩护遭牵连，因不愿“认罪连累家人”或“否认被绞死”而拒绝答辩，被平躺在地、胸口铺木板堆巨石，最终被压死，死前只说“更多石头”。此外至少5人死于狱中，监狱条件恶劣，有人因饥饿、疾病离世，还有孩子因父母被指控连带关押而夭折。
1692年10月，殖民地总督见“被指控者越来越多，甚至波及自己亲戚”，才下令停止审判、释放剩余嫌疑人。但直到1711年，马萨诸塞殖民政府才为部分受害者平反并赔偿家人，最后一名受害者的平反则等到2001年，距离浩劫已过去309年。