故事接续第一集结尾，传奇海盗杰克船长夺回鬼盗船后，继续徜徉在大海过着快乐的海盗生涯，但没想到又遭遇到大麻烦，遇上一个不朽的活死人、恐怖海盗首领戴维·琼斯（Davey Jones），他是“飞行荷兰人”鬼海盗船的船长。杰克的遭遇打乱了铁匠青年威尔与千金小姐伊丽莎白的结婚计划，他们知道杰克有麻烦，于是协助他度过难关，再一次的奇航冒险就此展开。

　　在游戏中，玩家扮演杰克船长，一边探险一边寻找活死人的珍宝，同时要利用环境通过各种手段解决遇到的难题，比如，砍断棕榈树作为桥梁，渡过幽深的峡谷等。最后，杰克船长还会同长得像海盗妖怪的BOSS大战一场。游戏比较类似《古墓丽影—传奇》（Tomb Raider Legend）和《生化危机4》（Resident Evil 4）。

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